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亞急性甲狀腺炎病因尚未完全明確，多數(shù)臨床患者發(fā)生于上呼吸道感染后。

發(fā)病時(shí)在患者血清中可檢查到某種病毒的抗體滴度升高，即可認(rèn)為是因?yàn)榧谞钕俑腥镜侥撤N病毒，如柯薩奇病毒、腮腺炎病毒、流感病毒、腺病毒，從而引起本病。本病也可能與非病毒感染有關(guān)，如Q熱或者瘧疾。

在該病活動(dòng)期患者的血循環(huán)中，發(fā)現(xiàn)有各種